Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PatjQ63ZW7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PatjQ63ZW7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PatjQ63ZW7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms