Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpd52Q62393 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms