Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scn9aQ62205 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scn9aQ62205 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scn9aQ62205 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms