Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gli3Q61602 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Gli3Q61602 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gli3Q61602 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gli3Q61602 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gli3Q61602 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms