Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Foxd1Q61345 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms