Protein–RNA interactions for Protein: Q61169

Gata6, Transcription factor GATA-6, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata6Q61169 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gata6Q61169 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gata6Q61169 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms