Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp17laQ61068 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17laQ61068 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms