Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DbpQ60925 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DbpQ60925 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DbpQ60925 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DbpQ60925 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DbpQ60925 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
DbpQ60925 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbpQ60925 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DbpQ60925 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DbpQ60925 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms