Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnot7Q60809 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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