Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ItgaeQ60677 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ItgaeQ60677 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms