Protein–RNA interactions for Protein: Q5Y4Y6

Gsdma3, Gasdermin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsdma3Q5Y4Y6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gsdma3Q5Y4Y6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Gsdma3Q5Y4Y6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gsdma3Q5Y4Y6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gsdma3Q5Y4Y6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gsdma3Q5Y4Y6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gsdma3Q5Y4Y6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gsdma3Q5Y4Y6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Gsdma3Q5Y4Y6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gsdma3Q5Y4Y6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gsdma3Q5Y4Y6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gsdma3Q5Y4Y6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gsdma3Q5Y4Y6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gsdma3Q5Y4Y6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gsdma3Q5Y4Y6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gsdma3Q5Y4Y6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Gsdma3Q5Y4Y6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gsdma3Q5Y4Y6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gsdma3Q5Y4Y6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gsdma3Q5Y4Y6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gsdma3Q5Y4Y6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gsdma3Q5Y4Y6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gsdma3Q5Y4Y6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Gsdma3Q5Y4Y6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gsdma3Q5Y4Y6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms