Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zzef1Q5SSH7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zzef1Q5SSH7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms