Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Kdm6bQ5NCY0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm6bQ5NCY0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm6bQ5NCY0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kdm6bQ5NCY0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm6bQ5NCY0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm6bQ5NCY0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm6bQ5NCY0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm6bQ5NCY0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm6bQ5NCY0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Kdm6bQ5NCY0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kdm6bQ5NCY0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kdm6bQ5NCY0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kdm6bQ5NCY0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Kdm6bQ5NCY0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kdm6bQ5NCY0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kdm6bQ5NCY0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kdm6bQ5NCY0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
Kdm6bQ5NCY0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
Kdm6bQ5NCY0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Kdm6bQ5NCY0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Kdm6bQ5NCY0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm6bQ5NCY0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms