Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CoblQ5NBX1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CoblQ5NBX1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CoblQ5NBX1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms