Protein–RNA interactions for Protein: Q5M956

Kctd1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd1Q5M956 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kctd1Q5M956 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Kctd1Q5M956 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kctd1Q5M956 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kctd1Q5M956 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kctd1Q5M956 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kctd1Q5M956 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kctd1Q5M956 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kctd1Q5M956 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kctd1Q5M956 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kctd1Q5M956 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kctd1Q5M956 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kctd1Q5M956 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kctd1Q5M956 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kctd1Q5M956 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kctd1Q5M956 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kctd1Q5M956 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kctd1Q5M956 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kctd1Q5M956 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kctd1Q5M956 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kctd1Q5M956 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kctd1Q5M956 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kctd1Q5M956 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms