Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SynaQ5G5D5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SynaQ5G5D5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms