Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTN8

Jakmip3, Janus kinase and microtubule-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jakmip3Q5DTN8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Jakmip3Q5DTN8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Jakmip3Q5DTN8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Jakmip3Q5DTN8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Jakmip3Q5DTN8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Jakmip3Q5DTN8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Jakmip3Q5DTN8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Jakmip3Q5DTN8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Jakmip3Q5DTN8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Jakmip3Q5DTN8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Jakmip3Q5DTN8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Jakmip3Q5DTN8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Jakmip3Q5DTN8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Jakmip3Q5DTN8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jakmip3Q5DTN8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jakmip3Q5DTN8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jakmip3Q5DTN8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jakmip3Q5DTN8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jakmip3Q5DTN8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Jakmip3Q5DTN8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Jakmip3Q5DTN8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Jakmip3Q5DTN8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms