Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrig2Q52KR2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrig2Q52KR2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms