Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spire1Q52KF3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Spire1Q52KF3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.1 ms