Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccnl1Q52KE7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccnl1Q52KE7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccnl1Q52KE7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms