Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2K7

1700123L14Rik, RIKEN cDNA 1700123L14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123L14RikQ3V2K7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
1700123L14RikQ3V2K7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
1700123L14RikQ3V2K7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
1700123L14RikQ3V2K7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
1700123L14RikQ3V2K7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
1700123L14RikQ3V2K7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
1700123L14RikQ3V2K7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
1700123L14RikQ3V2K7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
1700123L14RikQ3V2K7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
1700123L14RikQ3V2K7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
1700123L14RikQ3V2K7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.56■■■□□ 2
1700123L14RikQ3V2K7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
1700123L14RikQ3V2K7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
1700123L14RikQ3V2K7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
1700123L14RikQ3V2K7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
1700123L14RikQ3V2K7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
1700123L14RikQ3V2K7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1700123L14RikQ3V2K7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms