Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ulk4Q3V129 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ulk4Q3V129 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ulk4Q3V129 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ulk4Q3V129 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ulk4Q3V129 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ulk4Q3V129 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ulk4Q3V129 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ulk4Q3V129 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ulk4Q3V129 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ulk4Q3V129 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ulk4Q3V129 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ulk4Q3V129 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ulk4Q3V129 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ulk4Q3V129 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ulk4Q3V129 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ulk4Q3V129 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ulk4Q3V129 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ulk4Q3V129 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ulk4Q3V129 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ulk4Q3V129 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ulk4Q3V129 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms