Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnah12Q3V0Q1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms