Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc43Q3V0L5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrc43Q3V0L5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc43Q3V0L5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms