Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bbof1Q3V079 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bbof1Q3V079 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bbof1Q3V079 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bbof1Q3V079 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.4 ms