Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lrrfip1Q3UZ39 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrfip1Q3UZ39 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms