Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV9

Ncbp1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp1Q3UYV9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncbp1Q3UYV9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncbp1Q3UYV9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms