Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Slc38a11Q3USY0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc38a11Q3USY0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc38a11Q3USY0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms