Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf48Q3US17 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf48Q3US17 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms