Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TceancQ3US16 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TceancQ3US16 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms