Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbm20Q3UQS8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm20Q3UQS8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbm20Q3UQS8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbm20Q3UQS8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms