Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep63Q3UPP8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cep63Q3UPP8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms