Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cracr2aQ3UP38 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms