Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skap2Q3UND0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skap2Q3UND0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms