Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E330014E10RikQ3UL33 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
E330014E10RikQ3UL33 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms