Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH06

Rreb1, Ras-responsive element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rreb1Q3UH06 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rreb1Q3UH06 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rreb1Q3UH06 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rreb1Q3UH06 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rreb1Q3UH06 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rreb1Q3UH06 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rreb1Q3UH06 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rreb1Q3UH06 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rreb1Q3UH06 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rreb1Q3UH06 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rreb1Q3UH06 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rreb1Q3UH06 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rreb1Q3UH06 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Rreb1Q3UH06 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rreb1Q3UH06 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rreb1Q3UH06 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rreb1Q3UH06 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rreb1Q3UH06 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rreb1Q3UH06 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms