Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arfgef3Q3UGY8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Arfgef3Q3UGY8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms