Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nom1Q3UFM5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nom1Q3UFM5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms