Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnft2Q3UF64 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft2Q3UF64 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms