Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEZ8

Slc10a4, Sodium/bile acid cotransporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a4Q3UEZ8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc10a4Q3UEZ8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc10a4Q3UEZ8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc10a4Q3UEZ8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc10a4Q3UEZ8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc10a4Q3UEZ8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc10a4Q3UEZ8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc10a4Q3UEZ8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc10a4Q3UEZ8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc10a4Q3UEZ8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc10a4Q3UEZ8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc10a4Q3UEZ8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc10a4Q3UEZ8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc10a4Q3UEZ8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc10a4Q3UEZ8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc10a4Q3UEZ8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc10a4Q3UEZ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc10a4Q3UEZ8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc10a4Q3UEZ8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slc10a4Q3UEZ8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc10a4Q3UEZ8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms