Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3U6N9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3U6N9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3U6N9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3U6N9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3U6N9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q3U6N9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3U6N9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3U6N9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3U6N9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3U6N9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3U6N9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3U6N9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3U6N9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3U6N9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3U6N9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3U6N9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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