Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3W5

Prmt9, Protein arginine N-methyltransferase 9, mousemouse

Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt9Q3U3W5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prmt9Q3U3W5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prmt9Q3U3W5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prmt9Q3U3W5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms