Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3R4

Lmf1, Lipase maturation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmf1Q3U3R4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmf1Q3U3R4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmf1Q3U3R4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmf1Q3U3R4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms