Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud5Q3U2S4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Otud5Q3U2S4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otud5Q3U2S4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms