Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdm4dQ3U2K5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm4dQ3U2K5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms