Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc174Q3U155 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc174Q3U155 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms