Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Palb2Q3U0P1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Palb2Q3U0P1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Palb2Q3U0P1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms