Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLP5

Echdc2, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc2Q3TLP5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Echdc2Q3TLP5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Echdc2Q3TLP5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Echdc2Q3TLP5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms