Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGW2

Eepd1, Endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eepd1Q3TGW2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Eepd1Q3TGW2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Eepd1Q3TGW2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Eepd1Q3TGW2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Eepd1Q3TGW2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Eepd1Q3TGW2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Eepd1Q3TGW2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Eepd1Q3TGW2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Eepd1Q3TGW2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Eepd1Q3TGW2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Eepd1Q3TGW2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Eepd1Q3TGW2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Eepd1Q3TGW2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Eepd1Q3TGW2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Eepd1Q3TGW2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Eepd1Q3TGW2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Eepd1Q3TGW2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Eepd1Q3TGW2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Eepd1Q3TGW2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Eepd1Q3TGW2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Eepd1Q3TGW2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Eepd1Q3TGW2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms