Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDD9

Ppp1r21, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r21Q3TDD9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp1r21Q3TDD9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp1r21Q3TDD9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r21Q3TDD9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms